|🦠 ¡Clase Gratuita Online! Explorando el microbioma: análisis y visualización de datos metagenómicos con R
🦠 ¡Clase Gratuita Online! Explorando el microbioma: análisis y visualización de datos metagenómicos con R
Los estudios del microbioma pueden generar grandes tablas con información sobre numerosos microorganismos distribuidos entre distintas muestras. Para interpretar estos datos es necesario comprender cómo se organizan las abundancias, la información taxonómica y los metadatos experimentales.
En esta clase gratuita conocerás un flujo introductorio para analizar datos del microbioma utilizando R, desde tablas de abundancia y taxonomía hasta visualizaciones que permitan caracterizar y comparar comunidades microbianas.
También exploraremos conceptos fundamentales como abundancia relativa, composición taxonómica y diversidad microbiana, incluyendo riqueza, índices de Shannon y Simpson y una introducción a diversidad beta.
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¿Qué verás en esta clase?
• Qué es el microbioma y qué información puede proporcionar un estudio metagenómico.
• Conceptos de abundancia y taxonomía microbiana.
• Organización de tablas de abundancia.
• Relación entre muestras, microorganismos y metadatos.
• Diferencias entre abundancia absoluta y relativa.
• Exploración inicial de datos del microbioma con R.
• Identificación de taxones predominantes.
• Comparación entre muestras y grupos.
• Construcción de gráficos de abundancia relativa.
• Visualización de composición taxonómica.
• Introducción a diversidad alfa.
• Riqueza microbiana.
• Índices de Shannon y Simpson.
• Comparación de diversidad entre grupos.
• Introducción a diversidad beta.
• Integración de gráficos y métricas para una interpretación inicial.
A tomar en cuenta
💻 La clase se realizará de forma virtual mediante Google Meet.
📅 Lunes 26 de octubre
🇲🇽 México: 6:00 p. m.
🇵🇪 Perú | 🇨🇴 Colombia | 🇪🇨 Ecuador: 7:00 p. m.
🇧🇴 Bolivia | 🇻🇪 Venezuela: 8:00 p. m.
🇨🇱 Chile | 🇦🇷 Argentina: 9:00 p. m.
✅ No se requiere experiencia previa en análisis metagenómico.
✅ No se requiere experiencia avanzada en R.
Dinámica
Comenzaremos revisando cómo se representa un microbioma computacionalmente y cómo se relacionan las muestras, los microorganismos, la taxonomía y los metadatos.
Luego utilizaremos R para explorar los taxones presentes, identificar microorganismos predominantes y transformar abundancias para facilitar su interpretación.
Después construiremos visualizaciones de abundancia relativa y composición taxonómica, comparando diferentes muestras o grupos.
Finalmente, introduciremos conceptos de diversidad alfa y beta y veremos cómo integrar métricas y gráficos para realizar una interpretación inicial de los patrones presentes en las comunidades microbianas.
Al finalizar tendremos un espacio de preguntas y respuestas.
👨🏫 Docente: Luis Alejandro Pérez Timaná
Genetista y biotecnólogo por la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, con experiencia en programación aplicada a las biociencias, bioinformática y análisis de datos multi-ómicos.
Sus áreas de interés incluyen biología computacional, genética molecular y análisis computacional de datos biológicos.
💬 ¿Tienes preguntas?
Podrás dejarlas en el chat del evento y las responderemos durante la sesión.
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