Curso Intensivo: Procesamiento de datos scRNA-seq + Cómputo en la nube con Cell Ranger y Agentes de IA
De archivos FASTQ a matrices de expresión y exploración génica a nivel de célula individual
Si quieres aprender a generar matrices de expresión de célula individual con la asistencia de un agente de IA y explorar datos de scRNA-seq sin escribir código, este curso es para ti.
El curso combina demostraciones técnicas y práctica guiada para presentar un flujo de procesamiento claro y verificable.
Curso 100% en línea por Zoom
Duración: 6 horas
4 horas demostrativas
2 horas de práctica
🛑 Cupo limitado
¿Qué aprenderás?
Al finalizar el curso podrás:
Comprender el flujo de procesamiento de datos single-cell en 10x Genomics Cloud.
Organizar, cargar y descargar archivos de forma eficiente.
Configurar un análisis completo con Cell Ranger count.
Ejecutar y supervisar una ejecución en la nube.
Reconocer los principales archivos y métricas del resumen de resultados (QC).
Utilizar prompts estratégicos para solicitar operaciones y verificar las acciones realizadas por un asistente de IA.
Tips sobre gaps existentes dentras de los prompts.
Tres formas de trabajar
🌐 Interfaz web: Recorre visualmente el flujo de trabajo y comprende cómo se configuran y supervisan los análisis.
💻 Cloud CLI: Conoce cómo realizar operaciones desde la terminal y documentar procesos reproducibles.
🤖 Claude + Interfaz basada en prompts: Explora el uso de lenguaje natural para solicitar operaciones en la nube.
Programa: 06 y 08 de Octubre
Día 1 — De los datos a la configuración
Fundamentos del procesamiento single-cell en la nube, organización y transferencia de archivos, configuración de Cell Ranger count y práctica guiada.
Día 2 — Automatización, IA y resultados
Ejecución y supervisión de análisis, introducción a Cloud CLI, uso de Claude mediante prompts y revisión de resultados y métricas iniciales de control de calidad.
¿A quién está dirigido?
Biologos y estudiantes de posgrado.
Investigadores y personal académico.
Cualquier persona interesada en incorporar herramientas de nube e IA a sus flujos bioinformáticos.
Requisitos previos
Computadora con conexión estable a internet.
Conceptos básicos de datos FASTQ es un plus, pero no indispensable.
⚠️ Antes de la sesión: Recibirás un correo automático con las instrucciones para crear tus cuentas de acceso a los portales y descargar tus datos de práctica.
💡 Sobre la práctica: utilizaremos datos previamente preparados para aprovechar el tiempo en la configuración e interpretación, sin depender de tiempos de transferencia de datos.
No es necesario saber códificar, ní tener experiencia previa con datos scRNA-seq, ní Cell Ranger.
Alcance del mini-curso: El curso se concentrará exclusivamente en Cell Ranger count para datos de expresión génica single-cell.
Inversión
México: $500 MXN mediante transferencia SPEI.
Otros países: $30 USD mediante PayPal.
¿Eres estudiante? reclama tu 30% de descuento adjuntando tu comprobante de estudios. Escribe a arkheadmin@gmail.com Subject: Descuento para TU-NOMBRE-COMPLETO
Tu lugar quedará confirmado una vez validado el deposito.
¿Qué incluye tu inversión?
✅ 6 horas de formación en vivo.
✅ Demostraciones paso a paso y práctica guiada.
✅ Guía de consulta y recursos de apoyo.
✅ Acceso a la grabación del curso a posteriori.
Políticas del evento y logística
💳 Acceso a las sesiones: Una vez procesado y confirmado tu pago, Luma te enviará la confirmación de inscripción y el enlace para unirte a las sesiones por Zoom.
↩️ Política de reembolsos: Debido a que el cupo es limitado, podrás solicitar el reembolso total hasta 24 horas antes del inicio del curso. Después de ese plazo no se realizarán devoluciones.
📅 Reprogramación del curso: Si no se alcanza el número mínimo de participantes, el curso podrá ser reprogramado. Recibirás la notificación al menos 48 horas antes de la fecha de inicio y podrás elegir entre conservar tu inscripción para las nuevas fechas o solicitar el reembolso total.
Presenta
Cynthia Soto Cardinault, Doctora en Ciencias Biológicas, y Master en Ciencias de la Computación
Cynthia ha participado en proyectos de transcriptómica y epigenómica de célula única (single-cell), integración multiómica y transcriptómica espacial. Actualmente, es fundadora de El Arkhe Multiomics, para la formación en bioinformática y tecnologías genómicas emergentes.
Puedes consultar sus recursos abiertos y publicaciones en: